- 第一轮
| 2025-03-26 18:00 |  甲府风林 | VS | 藤枝MYFC  |
| 2025-03-26 18:00 |  FC大阪 | VS | 磐田喜悦  |
| 2025-03-26 18:00 |  水户蜀葵 | VS | 熊本深红  |
| 2025-03-26 18:00 |  大分三神 | VS | 山口雷法  |
| 2025-03-26 18:00 |  福岛联 | VS | 北海道札幌冈萨多  |
| 2025-03-26 18:00 |  松本山雅 | VS | 鸟栖砂岩  |
| 2025-03-26 18:00 |  爱媛FC | VS | 秋田蓝闪电  |
| 2025-03-26 18:00 |  FC今治 | VS | 德岛漩涡  |
| 2025-03-26 18:00 |  富山胜利 | VS | 千叶市原  |
| 2025-03-26 18:00 |  鹿儿岛联 | VS | 山形山神  |
| 2025-03-26 18:00 |  枥木SC | VS | 仙台七夕  |
| 2025-03-26 18:00 |  群马草津温泉 | VS | 长崎航海  |
| 2025-03-26 18:00 |  RB大宫松鼠 | VS | 磐城  |
| 2025-03-26 17:00 |  SC相模原 | VS | 清水心跳  |
| 2025-03-20 13:00 |  北九州向日葵 | VS | 冈山绿雉  |
| 2025-03-20 13:00 |  FC岐阜 | VS | 横滨FC  |
| 2025-03-20 13:00 |  高知联合 | VS | 大阪钢巴  |
| 2025-03-20 13:00 |  枥木市 | VS | 鹿岛鹿角  |
| 2025-03-20 13:00 |  长野帕塞罗 | VS | 东京绿茵  |
| 2025-03-20 13:00 |  沼津青蓝 | VS | 柏太阳神  |
| 2025-03-20 13:00 |  金泽萨维根 | VS | 湘南比马  |
| 2025-03-20 13:00 |  奈良 | VS | FC东京  |
| 2025-03-20 13:00 |  赞岐釜玉海 | VS | 大阪樱花  |
| 2025-03-20 13:00 |  宫崎棒牛鸟 | VS | 名古屋鲸鱼  |
| 2025-03-20 13:00 |  鸟取飞翔 | VS | 京都不死鸟  |
| 2025-03-20 13:00 |  FC琉球 | VS | 福冈黄蜂  |
| 2025-03-20 12:00 |  八户云罗里 | VS | 新潟天鹅  |
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